国内外在有机肥发酵腐熟度的方面已经有很深入的研究，有很多的评价指标及方法，但仍没有形成一种公认的堆肥腐熟度指标。
　　通常对于大众来说通常使用物理学指标来进行判断，物理学判断有如下指标温度、气味、颜色、吸光度变化，比较直观来说大众会从温度、气味、颜色上来进行区分。
　　在温度上，发酵的过程是温度从低逐渐升高高在降温的过程，腐熟过后发酵物温度会略高于环境温度，从而我们可以看出温度是发酵过程中很重要的指标之一。
　　在气味上，发酵原料具有难闻气味，并在发酵过程中产生硫化氢，氨等难闻气体，在发酵过程完成后这些难闻的气味减弱直到完全消失，所以气味也也可以作为堆肥腐熟的标准之一
　　在颜色上发酵过程中，发酵物料颜色逐渐加深，发酵完成后颜色呈黑色或黑褐色，所以在发酵过程中颜色是可以判断发酵是否完全腐熟的关键。
　　在化学指标上，有机质的变化指标，氨氮指标、腐殖化指标、碳氮比和有机酸等。实际应用中碳氮比指标较为常用，通过耗氧速率的测定以及氢氧化钠溶液吸收因堆料而产生的二氧化碳以此确定其产生量，但应用此评价方法受堆肥腐熟度等各方面因素影响往往会得到不同的结果，不能很直观反映植物生长特性。因此不能用单一指标来评价堆肥的腐熟度，所以使用化学指标与生物指标结合等多种方法来测定，再根据这些指标综合分析堆肥腐熟情况。